Introducere. Adresarea ADN-ului, și în special a structurilor sale non-canonice, cum ar fi
G-cvadruplexele (G4), oferă o cale promițătoare pentru terapia cancerului prin modularea
expresiei oncogenelor [1]. Unii liganzi specifici pot stabiliza structurile G4, prin aceasta
manifestând un potențial sporit de influențare a genelor-cheie care intervin în apariția și
dezvoltarea cancerului [2]. Noi am identificat recent compusul din titlu, conținând
molecula fuzionată cu farmacofori de fenantridină și indolinonă, care a prezentat
activitate antiproliferativă pe liniile celulare de glioblastom LN229 și carcinom pulmonar
NCI-H460 [3].
Scopul lucrării. Evaluarea compusului din titlu ca ligand ADN-specific pentru
recunoașterea a două structuri diferite de ADN G4, prin metoda spectroscopiei
dicroismului circular (CD).
Material și metode. Sinteza compusului din titlu a fost realizată utilizând protocolul
descris [4]. Secvențele de ADN G4 utilizate: 5'-TTG GGA TTG GGA TTG GGA TTG GGA TT3' (htG4)- mostră comercială, Metabion AG (Planegg, Germania) și 5'-TTG GGA TTG GGA
TTG GGA TTG GGA TT- 3' ( M2 G4)- mostră sintetizată pe sintetizator H-8 (K&A
LaborGerȅate) cu utilizarea chimiei fosforamidit standard, urmată de deprotecție cu
amoniac apos [5].Spectrele CD au fost înregistrate pe un spectrofotometru Chirascan Plus
(Applied Photophysics Ltd., Leatherhead, Surrey, Marea Britanie).
Rezultate. Studiile interacțiunilor dintre compusul din titlu și ADN G4 cu două topologii
diferite: 1) telomeric uman de structură hibridă [3+1] (htG4) și 2) M2 G4 cu catena
paralelă au fost realizate prin experimente de titrare CD. Acestea au demonstrat, că
compusul recunoaște în mod selectiv structurile G4, contrar cazului ADN-ul duplex [3],
prezentând modele distincte de legare pentru ambele secvențe G4 testate. În special, în
spectrele CD ale htG4, compusul a crescut intensitatea benzii pozitive la 290 nm, sugerând
stabilizarea G4 prin interacțiuni de stivuire cu tetradele acestuia. Dimpotrivă, la titrarea
M2 G4 cu compusul din titlu, a fost observată o scădere a benzilor caracteristice ale G4
(265 nm pozitivă și 243 nm negativă), indicând asupra interacțiunilor care cel mai
probabil destabilizează structura G4 [6].
Concluzii. Cercetarea a confirmat, că compusul din titlu are potențial de legare și
stabilizare în mod selectiv a conformațiilor non-canonice ale ADN-ului de structură G4,
ceea ce este un succes promițător vizând terapia țintită în oncologie.
Introduction. Targeting DNA, especially via non-canonical structures such as Gquadruplexes (G4s), offers a promising route for cancer therapy by modulating oncogene
expression [1]. Specific ligands can stabilize G4 structures, potentially influencing key
cancer-related genes [2]. We have recently identified the title-compound, containing a
fused molecule with phenanthridine and indolinone pharmacophores that showed
antiproliferative activity in Glioblastoma LN229 and Lung Carcinoma NCI-H460 cell lines
[3].
Aim of the work. Evaluation of the title compound as a plausible specific DNA binder for
recognizing two different G4 DNA structures by circular dichroism (CD) spectroscopy.
Material and methods. Synthesis of the title compound has been performed by using a
described protocol [4]. The used G4 DNA sequences: 5’-TTG GGA TTG GGA TTG GGA TTG
GGA TT- 3’ (htG4)- commercial sample, Metabion AG (Planegg, Germany) and 5’-TTG GGA
TTG GGA TTG GGA TTG GGA TT- 3’ (M2 G4)- synthesized on H-8 synthesizer (K&A
LaborGerȅate) with the use of standard phosphoramidite chemistry, followed by
deprotection with aqueous ammonia [5]. CD spectra were recorded using a Chirascan Plus
spectrophotometer (Applied Photophysics Ltd., Leatherhead, Surrey, UK).
Results. Binding studies between the title compound and DNA comprising two different
G4 topologies: the human telomeric hybride [3+1] (htG4) and the parallel-stranded M2
G4 were assessed by CD titration experiments. They indicate that compound selectively
recognizes G4 structures over duplex DNA [3], showing distinct binding patterns for both tested G4 sequences. Particularly, in the CD spectra of htG4, compound increased the
positive band intensity at 290 nm, suggesting G4 stabilization through stacking
interactions with its G-tetrads. For M2 G4, however, a dose-dependent decrease in
characteristic G4 bands (265 nm positive, 243 nm negative) was observed, indicating endstacking interactions that more likely destabilize the G4 structure [6].
Conclusions. We demonstrate that title compound has potential to selectively bind and
stabilize specific non-canonical DNA G4 structures, being a promising step toward
targeted cancer therapies
